Actualmente el Aeropuerto de Praga no está comunicado directamente por ningún ferrocarril. Aunque hay planes en curso para comunicar directamente el aeropuerto por tren, no se construirá antes de 2020 y se espera que todo el proyecto concluya en 2023-24.
Los primeros planes anunciados para una extensión ferroviaria conducirían desde Praga 6 (Veleslavín, desde donde van los autobuses al aeropuerto ahora) hasta el aeropuerto de Václav Havel, con líneas adicionales que continúan hasta Kladno. El ferrocarril conectaría directamente el aeropuerto con el centro de la ciudad en la estación Masákovo nádraží de Praga. En las horas pico, seis trenes por hora podrían hacer un viaje de 27 minutos tan rápido como el viaje en taxi. Los trenes a Veleslavín deberían de llegar al aeropuerto en solo 11 minutos.
En este momento, la forma más fácil de llegar a la estación principal de trenes de Praga (Praha hlavní nádraží), desde donde se hace una transferencia directa al servicio de trenes que opera a otros destinos dentro de la República Checa y en el extranjero, es usar el autobús Airport Express.
Las paradas para bajar de los autobuses AE están ubicadas directamente en frente del edificio de la terminal en la Terminal 1 y en la Terminal 2 (no para subir al autobús). Si llegas a la Terminal 2, ten en cuenta que el autobús AE sale únicamente de la Terminal 1. El tiempo de viaje hasta allí es de unos 25 a 35 minutos, dependiendo del tráfico.
Para usar este servicio, necesitas comprar boletos de autobús de Airport Express. Los boletos se pueden comprar directamente al conductor del autobús o en el Centro de Visitantes en la sala de llegadas. Ten en cuenta que los boletos de transporte público (MHD) no son válidos para este servicio.