チェックインカウンターは、ターミナル1、2の出発ホールにあります。チェックインの際は、航空券（紙または電子式）、バウチャーまたはご予約コード、国際便には身分証明書とビザをご用意ください。通常チェックインカウンターは、ご搭乗便出発時刻の2時間前に開き、30分前に終了します。ご利用になる航空会社のチェックインカウンターについて、正確な営業時間を事前にご確認ください。
チェックインカウンターでは、お手荷物をお預けになり（お手荷物には目的地を示すラベルが貼られます）、ご搭乗口が記載された搭乗券と手荷物引換証をお受け取りください。その後、セキュリティ審査または出入国審査へお進みください。
大型のお手荷物
傘、ベビーカー、自転車、スキー、サーフボード、箱型のお荷物などの規格外または大型のお手荷物を持ってご旅行される場合は、チェックインデスクでエージェントがお荷物の取り扱いについて手配いたします。こうしたお荷物は、｢規格外荷物｣のラベルが貼られ、特別カウンターから配送されます。特別カウンターは、ターミナル1、2の出発ホールにあります。規格外荷物を多くお持ちになる場合は、特別な輸送条件の対象となる可能性があるので、取り扱いについて、直接航空会社（チャーター便の場合は旅行代理店）にお問い合わせください。
インターネットでのチェックイン
電子チケットをお持ちの場合、ご搭乗便出発時刻の48時間～3時間前までに、ご自宅や勤務先でオンラインを利用してチェックインが可能です。これは、各航空会社が定める基準によって違います。オンラインチェックインが可能な航空会社は以下です。インターネットでチェックインいただくと、時間が節約でき、プラハ空港でより長時間快適な時間をお過ごしいただけます。
Airlines with Online check-in possibility:
携帯電話でチェックイン
最新のチェックイン手段には、携帯電話を利用する方法もあります。
必要なのはインターネット接続のある携帯電話のみで、携帯電話でのチェックインに対応している、ご利用になる航空会社のウェブサイトから、SMS、MMSまたは電子メールで2次元バーコードが携帯電話に直接届きます。その後、空港でそのコードを特殊デバイスに配置するだけで搭乗可能です。
この画期的なサービスは、スピード、独立性、柔軟性のニーズを完全に満たしています。
Airlines with mobile phone check-in possibility:
| Aer Lingus |
| Aeroflot |
| Air France |
| Austrian Airlines |
| British Airways |
| Brussels Airlines |
| ČSA |
| Emirates |
| Finnair |
| Germanwings |
| Iberia |
| KLM |
| LOT |
| Lufthansa |
| Swissair |
| TAP Portugal |
| Volotea |
| Vueling |
| Wizzair |
キヨスクでのセルフサービス・チェックイン
ターミナル2に16ヶ所、ターミナル1に9ヶ所あるキヨスクでご利用いただけます。現在セルフサービス・チェックインができる航空会社は、アエロフロート、エールフランス航空、オーストリア航空、ブリュッセル航空、CSA、デルタ航空、フィンランド航空、イベリア航空、KLMオランダ航空、ルフトハンザドイツ航空、トルコ航空です。将来的には、ご利用いただける航空会社が増える見込みです。
上記の航空会社をご利用のお客様は、電子チケットで、キヨスクでセルフサービス・チェックインが可能です。便によってはご利用いただけない場合もございます。万一ご利用いただけない場合は、チェックインカウンターまでお越しください。
セルフサービス・チェックインをご利用いただく際は、電子チケット番号またはご予約コードをご入力いただいた後、パスポートのダウンロード、磁気ストリップ付きのクレジットカード、または印刷済みの搭乗券による身分確認がございます。最後に電子チケットの番号やロイヤリティプログラムのカード番号をご入力ください。
機内にお持込になる手荷物のみでご旅行の場合は、チェックイン後、該当する搭乗口までお進みください。手荷物をお預けになる場合は、通常のチェックインカウンター付近にある｢手荷物お預かり(Baggage drop-off)｣カウンターまでお越しください。ここで手荷物引換証をお受け取りいただいたら、そのままセキュリティ審査または出入国審査へお進みください。このタイプのチェックインは、下記の航空会社でご利用いただけます。
セルフチェックインで、素早く簡単にチェックインいただけ、より長時間プラハ空港で快適にお過ごしいただけます。
Airlines with self check-in: